呼伦湖属富营养型湖泊。共有鱼类33种，分属5目8科2亚科。主要经济鱼类有鲤鱼、鲫鱼、红鳍鲌、蒙古红鲌、餐鲦、鲶鱼6种，年产量达万吨以上。此外，湖中还盛产秀丽白虾。秀丽白虾又称秀丽长臂虾，是呼伦湖中唯一的经济虾类，具有生长快、食性广、繁殖力强、营养价值高等特点，是高蛋白、低脂肪生物，鲜虾所含粗蛋白比同水域鱼类高许多。年产量在二千吨左右。

小白鱼、鲤鱼、白鱼、鲫鱼、狗鱼、鲶鱼、秀丽白虾、雅罗鱼通过国家有机食品认证。